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離心知識(shí)大闖關(guān) | 第二期:離心方法介紹

點(diǎn)擊次數(shù):11 更新時(shí)間:2025-09-11


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第二期


離心方法介紹


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常用的離心方法及其離心原理


在實(shí)驗(yàn)過(guò)程中,由于實(shí)驗(yàn)?zāi)康牟煌蜆悠返母鞣N性質(zhì)差異,只有選擇了正確的離心方法,才能獲得預(yù)期的分離純化結(jié)果。今天的離心課堂將為大家介紹幾種常用的離心方法并闡述其離心原理,幫助大家日后更好地理解并應(yīng)用。


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解鎖離心相關(guān)小知識(shí)~

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利用樣品中各組分沉降系數(shù)的差異,對(duì)不同的微粒施以不同的離心力,經(jīng)過(guò)多次離心,離心速度逐步加大,將不同的微粒依次沉降,從而實(shí)現(xiàn)離心分離。以不同的離心力分離不同粒徑的微粒是動(dòng)力學(xué)的分離方法。


如果分離樣品中有大中小三種不同粒徑的微粒,對(duì)它們施以不同的離心力,大粒徑的微粒,其質(zhì)量較大,首先沉降。分離上清液,以更大轉(zhuǎn)速對(duì)上清液進(jìn)行第二次離心,中顆粒被分離出來(lái)。再取上清以更大離心力,更高的轉(zhuǎn)速,最后沉降小顆粒,以達(dá)到不同顆粒的分離,如圖1所示。由于在每種顆粒的沉淀物中總含有部分次級(jí)顆粒,如想將某種顆粒提純,需對(duì)該顆粒的沉淀物進(jìn)行稀釋后再離心沉淀,最終可制備出理想純度的顆粒。


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圖1:差速離心


差速離心主要用于分離直徑和密度差異較大的顆粒和大量樣品的初步分離提純。

優(yōu)點(diǎn):

分離時(shí)間短、重復(fù)性高,樣品處理量大

缺點(diǎn):

分離復(fù)雜樣品和要求分離純度較高時(shí),離心次數(shù)多,操作繁雜。由于沉淀的多次清洗、溶解、再沉淀,容易引起中間損失,所以離心分辨力差。

實(shí)際分離時(shí)由于離心時(shí)的對(duì)流、擴(kuò)散和收取沉淀時(shí)的污染,對(duì)于一些沉降系數(shù)相差不大的組分無(wú)法進(jìn)行完全的分離提純,樣品的純度和回收率都不理想。


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以動(dòng)物肝組織勻漿液為例,對(duì)勻漿液進(jìn)行多次的不同相對(duì)離心力和時(shí)間的離心和沉淀/上清分步收集,就可以得到樣品的細(xì)胞核、線粒體、溶酶體和核糖體等的初步分離富集沉淀,用于下一步的其他檢測(cè)或者精細(xì)純化實(shí)驗(yàn)。具體處理流程如圖2所示。


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圖2:通過(guò)差速離心對(duì)動(dòng)物肝組織勻漿液進(jìn)行多次分離,得到不同樣品

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定義:密度梯度離心是一種借助離心力和液體密度梯度,將顆粒按密度差異進(jìn)行分離和純化的技術(shù)。通過(guò)制備自上而下遞增的密度梯度液柱,并在頂部加載樣品,離心時(shí)不同密度的顆粒會(huì)在與其自身密度相等的液層處形成條帶,從而得以分離。

優(yōu)點(diǎn):

可以同時(shí)使樣品中幾種或全部組分分離,具有良好的分辨率,分離效果好,可一次獲得較純組分。

缺點(diǎn):

缺點(diǎn):離心時(shí)間較長(zhǎng),需制備梯度液,操作要求高。

按照離心分離原理,密度梯度離心又可分為速率區(qū)帶離心和等密度梯度離心。



速率區(qū)帶離心(Rate zonal centrifugation)


根據(jù)樣品中不同組分粒子所具有的不同的體積大小和不同的沉降系數(shù),將混合樣品進(jìn)行離心分離提純。離心時(shí)將需要分離的樣品溶液置于由密度梯度材料,如蔗糖等形成的梯度液柱上面,且樣品粒子的密度必須大于梯度液柱中任一點(diǎn)的密度,否則得不到理想的區(qū)帶離心效果。離心時(shí),混合樣品中不同的組分將在梯度液柱的不同位置分別形成各自的區(qū)帶,選擇適合的轉(zhuǎn)速和時(shí)間進(jìn)行離心,當(dāng)各組分區(qū)帶距離拉得最遠(yuǎn)時(shí),結(jié)束離心,然后將區(qū)帶取出(圖3)。這樣只需通過(guò)一次離心就可以把混合樣品中的各組分分離提純,其純度和回收率均可滿足要求。


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圖3:速率區(qū)帶離心


工作原理:


1

制備密度梯度:將密度較低(輕)的緩沖液置于離心管頂部,下方依次疊加密度遞增的緩沖液,形成連續(xù)或不連續(xù)的密度梯度。

2

加樣:把含有目標(biāo)顆粒的樣品輕輕鋪加于梯度液柱頂部。

3

離心:在高速離心力作用下,顆粒沿離心力方向沉降。

4

收集:停止離心后,通過(guò)穿刺、吸液或冷凍切割管壁等方法,按層收集不同條帶中的顆粒。


優(yōu)點(diǎn):

通過(guò)一次分離純化,組分的沉降系數(shù)相差20%以上的即可選用此法,分辨力高,操作熟練可以將組分沉降系數(shù)相差5%~10%的樣品很好的分離。

缺點(diǎn):

材料的條件限制,樣品液濃度不能太高,否則操作條件很難控制,同時(shí)此法與差速離心法相比,處理樣品的量要小的多

要點(diǎn):

速率區(qū)帶離心的時(shí)間必須嚴(yán)格控制。時(shí)間不能太短,否則樣品區(qū)帶不清;也不能太長(zhǎng),否則待分離組分可能沉底。需要分離的樣品顆粒的沉降速度取決于顆粒形狀、大小、密度及離心力等因素。


案例


其最經(jīng)典的應(yīng)用就是通過(guò)蔗糖密度梯度離心,進(jìn)行各種亞細(xì)胞器(核糖體、線粒體、Exosome等)和病毒顆粒(病毒載體、疫苗等)的純化。以70S核糖體沉淀為例,經(jīng)過(guò)水解后,可利用蔗糖密度梯度離心,進(jìn)一步分離純化得到50S和30S的兩個(gè)亞基。具體的實(shí)驗(yàn)流程如圖4所示。


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圖4:以70S的核糖體為例,水解后可通過(guò)蔗糖密度梯度離心,進(jìn)一步分離純化得到50S和30S的兩個(gè)亞基



等密度梯度離心 (isopycnic centrifugation)


等密度梯度離心是根據(jù)樣品中各組分的浮力密度差不同進(jìn)行分離。在離心力場(chǎng)中,溶液中顆粒浮力密度小則上浮,浮力密度大則下沉,上浮和下沉的顆粒會(huì)一直延梯度液移動(dòng)到與其浮力密度恰好相等的位置上,該位置也稱顆粒的等密度點(diǎn)

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  • σ>ρ時(shí),v>0即樣品順離心力方向沉降

  • σ<ρ時(shí),v<0即樣品逆離心力方向上浮 

  • σ=ρ時(shí),v=0即樣品停止沉降或上浮,“穩(wěn)定”在這一位置


工作原理


1

制備密度梯度和加樣:

a) 等密度平衡區(qū)帶(Equilibrium Zonal):將密度較低(輕)的緩沖液置于離心管頂部,下方依次疊加密度遞增的緩沖液,形成不連續(xù)的密度梯度。把含有目標(biāo)顆粒的樣品輕輕鋪加于梯度液柱頂部。

b) 等密度梯度(Isopycnic):將自形成連續(xù)密度梯度液與樣品直接混合

2

離心:在高速離心力作用下,顆粒沿管長(zhǎng)方向沉降或上浮,直至達(dá)到與其密度相同的液層(等密度點(diǎn))。

3

收集:停止離心后,通過(guò)穿刺管底、吸液或冷凍切割管壁等方法,按層收集不同密度條帶中的顆粒。

等密度梯度離心前后樣品的狀態(tài)如圖5所示。因此,在離心前,樣品可置于梯度液的任意位置,一般是均勻分布在梯度液中。


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圖5:等密度梯度離心


要點(diǎn):

離心時(shí)樣品各組分顆粒將按其密度大小分別移至等密度點(diǎn)形成區(qū)帶,形成的區(qū)帶不會(huì)因離心時(shí)間長(zhǎng)而發(fā)生變化。離心后收集所需區(qū)帶顆粒即為純化組分。等密度梯度離心法的離心效果取決于樣品顆粒的浮力密度差,密度差越大,分離效果越顯著,與樣品顆粒的大小與形狀無(wú)關(guān)。


等密度梯度離心經(jīng)常使用的梯度液包括氯化銫(CsCI)、溴化鈉等,典型的應(yīng)用包括質(zhì)粒 DNA(或者其他DNA、RNA核酸片段)的大規(guī)模高純度純化,脂蛋白的分離純化等(圖6-7)。


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圖6:質(zhì)粒DNA的氯化銫等密度梯度離心分離純化流程


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圖7:脂蛋白溴化鈉等密度梯度離心分離純化流程



梯度介質(zhì)


在密度梯度離心操作中,梯度介質(zhì)的鋪設(shè)是決定分離精度的核心步驟。


常用介質(zhì)必須具備以下特性以確保樣品完整性與實(shí)驗(yàn)重現(xiàn)性:

  • 足夠高的溶解度,可形成所需密度

  • 低黏度,利于快速沉降

  • 化學(xué)惰性或低生物毒性,不損傷生物活性

  • 易于去除或不影響下游實(shí)驗(yàn)


根據(jù)目標(biāo)顆粒的沉降系數(shù)或浮力密度,可參考下圖(圖9)選用合適介質(zhì)鋪設(shè)連續(xù)梯度液不連續(xù)梯度液連續(xù)梯度液密度變化是平滑連續(xù)的,不連續(xù)梯度液密度是分層的、呈階梯式變化(圖10)。因此,連續(xù)梯度用于精細(xì)分離大小相近的顆粒(如不同構(gòu)象的DNA),分辨率取決于斜率;不連續(xù)梯度更像篩子,先快速分層,再在階梯界面處“把關(guān)”,常用于先粗分、后回收,兼顧速度與通量。


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圖9:常用梯度液及應(yīng)用范圍


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圖10:連續(xù)密度梯度液和不連續(xù)密度梯度液


接下來(lái),也給大家介紹幾種較常用的密度梯度液(圖11)。


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圖11:幾種比較常用的密度梯度液


密度梯度實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)考慮要點(diǎn):

  • 梯度類型選擇:連續(xù)梯度(continuous)可獲更高分辨率;不連續(xù)梯度(step)操作更快。

  • 轉(zhuǎn)速與時(shí)間:需經(jīng)實(shí)驗(yàn)優(yōu)化,避免過(guò)度離心導(dǎo)致顆粒聚集或梯度破壞。

  • 溫度:4 °C常用于保護(hù)生物活性。

  • 樣品體積:一般不超過(guò)梯度體積的10–20%,以防過(guò)載。

  • 無(wú)菌操作:病毒或細(xì)胞實(shí)驗(yàn)需全程無(wú)菌。


密度梯度離心以其高分辨率、溫和條件和廣泛適用性,成為細(xì)胞和分子生物學(xué)研究的核心技術(shù)之一。選擇合適的梯度介質(zhì)、優(yōu)化梯度形狀及離心參數(shù),是實(shí)現(xiàn)高效分離的關(guān)鍵。我們?cè)诖艘才e例了比較常用的應(yīng)用場(chǎng)景(圖12),幫助大家快速選擇。


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圖12:氯化銫和碘克沙醇密度梯度液的應(yīng)用場(chǎng)景舉例

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本期課堂主要圍繞常見(jiàn)的幾種離心方法,展開(kāi)介紹了其原理和優(yōu)缺點(diǎn),并舉例了幾種常用的密度梯度介質(zhì)。下一期離心課堂,我們將圍繞離心所用轉(zhuǎn)子和耗材進(jìn)行介紹,期待給大家分享更多離心相關(guān)小知識(shí)!

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